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1.
Biomédica (Bogotá) ; 39(1): 88-101, ene.-mar. 2019. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1001392

ABSTRACT

Abstract Introduction: Host genetics is recognized as an influential factor for the development of dengue disease. Objective: This study evaluated the association of dengue with the polymorphisms rs8192284 for gene IL6R, rs3775290 for TLR3, and rs7248637 for DC-SIGN. Materials and methods: Of the 292 surveyed subjects, 191 were confirmed for dengue fever and the remaining 101 were included as controls. The genotypes were resolved using polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism (PCR- RFLP). In an attempt to determine the risk (Odds Ratio) of suffering dengue fever, data were analyzed using chi-square for alleles and logistic regression for both genotypes and allelic combinations. Confidence intervals were set to 95% for all tests regardless of the adjustment by either self-identification or ancestry. Results: For Afro-Colombians, the allele rs8192284 C offered protection against dengue [OR=0.425,(0.204-0.887), p=0.020]. The alleles rs7248637 A and rs3775290 A posed, respectively, an increased risk of dengue for Afro-Colombians [OR=2.389, (1.170-4.879), p=0.015] and Mestizos [OR=2.329, (1.283-4.226), p=0.005]. The reproducibility for rs8192284 C/C [OR=2.45, (1.05-5.76), p=0.013] remained after adjustment by Amerindian ancestry [OR=2.52, (1.04-6.09), p=0.013]. The reproducibility for rs3775290 A/A [OR=2.48, (1.09-5.65), p=0.033] remained after adjustment by European [OR=2.34, (1.02-5.35), p=0.048], Amerindian [OR=2.49, (1.09-5.66), p=0.035], and African ancestry [OR=2.37, (1.04-5.41), p=0.046]. Finally, the association of dengue fever with the allelic combination CAG [OR=2.07, (1.06-4.05), p=0.033] remained after adjustment by Amerindian ancestry [OR=2.16, (1.09-4.28), p=0.028]. Conclusions: Polymorphisms rs8192284 for IL6R, rs3775290 for TLR3, and rs7248637 for DC-SIGN were associated with the susceptibility to suffer dengue fever in the sampled Colombian population.


Resumen Introducción. La genética del huésped se reconoce como un factor que influye en el desarrollo del dengue. Objetivo. Este estudio evaluó la asociación del dengue con los polimorfismos rs8192284 del gen IL6R, rs3775290 del TLR3 y rs7248637 del DC-SIGN. Materiales y métodos. De los 292 sujetos encuestados, en 191 se confirmó la presencia de fiebre por dengue y los restantes 101 se incluyeron como controles. Los genotipos se resolvieron mediante reacción en cadena de la polimerasa y polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (PCR-RFLP). En un intento por determinar el riesgo de sufrir dengue, los datos se analizaron mediante la prueba de ji al cuadrado para los alelos y la regresión logística para los genotipos y las combinaciones alélicas. Los intervalos de confianza se calcularon a 95 % para todas las pruebas independientemente ajustadas por autoidentificación o componente genético ancestral. Resultados. En los afrocolombianos, el alelo C rs8192284 ofreció protección contra el dengue (OR=0,425; 0,204-0,887, p=0,020). Los alelos A rs7248637 y Ars3775290 plantearon un mayor riesgo de dengue para los afrocolombianos (OR=2,389; 1,170- 4,879; p=0,015) y los mestizos (OR=2,329; 1,283-4,226: p=0,005), respectivamente. La reproducibilidad para rs8192284 C/C (OR=2,45; 1,05-5,76; p=0,013) permaneció después del ajuste por el componente genético ancestral amerindio (OR=2,52; 1,04- 6,09; p=0,013). La reproducibilidad del rs3775290 A/A (OR=2,48; 1,09-5,65; p=0,033) permaneció después del ajuste por el componente europeo (OR=2,34; 1,02-5,35; p=0,048), el amerindio (OR=2,49; 1,09- 5,66; p=0,035), y el africano (OR=2,37; 1,04- 5,41; p=0,046). Por último, la asociación del dengue con la combinación alélica CAG (OR=2,07; 1,06-4,05; p=0,033) permaneció después del ajuste por el componente genético amerindio (OR=2,16; 1,09-4,28;p=0,028). Conclusión. Los polimorfismos rs8192284 en IL6R, rs3775290 en TLR3 y rs7248637 en DC-SIGN, se asociaron con la propensión a sufrir dengue en una muestra de población colombiana.


Subject(s)
Adult , Female , Humans , Male , Polymorphism, Restriction Fragment Length , Cell Adhesion Molecules/genetics , Receptors, Cell Surface/genetics , Receptors, Interleukin-6/genetics , Dengue/genetics , Lectins, C-Type/genetics , Toll-Like Receptor 3/genetics , Genetic Variation , Colombia , Genetic Predisposition to Disease
2.
Acta neurol. colomb ; 34(3): 175-183, sep.2018. tablas, gráficas
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-968819

ABSTRACT

INTRODUCCIÓN: las epilepsias genéticas generalizadas (EGG) siguen patrones de herencia compleja. Este fenotipo es producto de la interacción de diferentes genes con factores ambientales. Los genes/loci más consistentemente asociados con este grupo de epilepsias son ECA1, ECA2-GABRG2, ECA3-CLCN2 (también conocido como JME6-CLCN2), JME1-EFHC1 y JME5-GABRA1. En Colombia poco se sabe sobre la contribución de las variantes genéticas en estos genes a la susceptibilidad para ser afectado por cualquiera de las formas de EGG. Nuestro propósito fue evaluar el papel de los cinco genes/loci más consistentemente asociados en otros estudios en un grupo de familias colombianas con EGG. MÉTODOS: se evaluaron dos marcadores para cada locus/gen. Los genotipos se obtuvieron mediante las técnicas de PCR-RFLP y ARMS-Tetraprimer. Los análisis estadísticos incluyeron pruebas de asociación alélica y haplotípica, además de pruebas de interacción gen-gen. RESULTADOS: se incluyeron 98 familias, de las cuales 51 fueron epilepsia de ausencias, mientras que 47 fueron epilepsia mioclónica juvenil. Se identificó una interacción significativa entre el alelo G del marcador rs4428455 (valor P=0,0008; gen GABRA1) y el alelo G de marcador rs719395 (valor P=0,002; gen EFHC1). CONCLUSIÓN: estos dos marcadores parecen incrementar el riesgo de EGG en población colombiana. Otros genes no analizados aquí podrían estudiarse con una muestra de mayor tamaño


INTRODUCTION: Generalized genetic epilepsies (GGE) follow complex inheritance patterns. This phenotype is due to interaction of several genes with environmental factors. The genes/loci most consistently associated with this group of epilepsies are ECA1, ECA2-GABRG2, ECA3-CLCN2 (also known as JME6-CLCN2), JME1-EFHC1 and JME5-GABRA1. In Colombia, little is known about the contribution of gene variants to susceptibility to GGE forms. Our purpose was to evaluate the role of the five most consistently associated genes /loci in other studies, in Colombian families set with GGE. METHODS: Genotypes were obtained by means of PCR-RFLP and ARMS-Tetraprimer. Statistical analyses included both allelic and haplotypic association tests, in addition to gene-gene interaction tests. Two genetic markers were tested for each gene/locus. RESULTS: Ninety-eight families were included, from which 51 had absence epilepsy, and 47 had juvenile myoclonic epilepsy. A significant interaction was identified between allele G at marker rs4428455 (P-value= 0.0008; gene GABRA1) and allele G at marker rs719395 (P-value= 0.002; gene EFHC1). CONCLUSION: Our results suggest that these two markers are associated with GGE in the Colombian population. Other genes not analyzed could be tested using a larger sample size.


Subject(s)
Humans , Epilepsy, Generalized , Epilepsy , Genes
3.
Biomédica (Bogotá) ; 37(4): 486-497, oct.-dic. 2017. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-888493

ABSTRACT

Resumen Introducción. La composición genética del huésped determina, entre otros aspectos, el perfil clínico del dengue, lo cual se debería al efecto de variantes en los genes que codifican citocinas proinflamatorias. Objetivo. Evaluar la asociación entre las variantes de tres polimorfismos en los genes candidatos TNFA, IL6 e IFNG con la gravedad del dengue en una población colombiana. Materiales y métodos. Se evaluaron los polimorfismos rs1800750, rs2069843 y rs2069705 de los genes TNFA, IL6 e IFNG, respectivamente, en 226 pacientes con dengue. Los genotipos se tipificaron usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y los polimorfismos de la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Para determinar el riesgo de diferentes fenotipos del dengue, se compararon las frecuencias alélicas con la prueba de ji al cuadrado, y los genotipos y los haplotipos, con regresión logística. Por último, los análisis se ajustaron utilizando datos de autoidentificación o del componente genético ancestral. Resultados. El alelo A del rs2069843, ajustado por autoidentificación, se asoció con casos de dengue hemorrágico en afrocolombianos. En la muestra completa, dicho polimorfismo, ajustado por componente genético ancestral, fue reproducible. Además, hubo asociaciones significativas entre las combinaciones alélicas GGT y GAC de los rs1800750, rs2069843 y rs2069705 en pacientes con dengue hemorrágico, con ajuste por componente genético ancestral y sin él. Además, la combinación alélica AGC produjo 58,03 pg/ml más de interleucina 6 que la GGC, independientemente de los componentes genéticos europeo, amerindio y africano. Conclusión. Las variantes de los polimorfismos GGT y GAC de los rs1800750, rs2069843 y rs2069705 en los genes TNFA, IL6 e IFNG, respectivamente, se correlacionaron con la gravedad del dengue en esta muestra de población colombiana.


Abstract Introduction: The genetic makeup of the host contributes to the clinical profile of dengue. This could be due to the effect of variants in the genes encoding pro-inflammatory cytokines. Objective: To evaluate the association between the variants of three polymorphisms in TNFA, IL6 and IFNG candidate genes with dengue severity in a sample of Colombian population. Materials and methods: We evaluated the rs1800750, rs2069843, and rs2069705 polymorphisms in TNFA, IL6 and IFNG candidate genes, respectively, in 226 patients with dengue infection. The genotypes were typed using both polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP). To determine the risk of different dengue phenotypes, we compared allele frequencies with chisquare and genotypes and haplotypes using logistic regression. Finally, these analyzes were adjusted with data from self-identification or the ancestral genetic component. Results: The A allele in the rs2069843 polymorphism, adjusted by self-identification, was associated with dengue hemorrhagic fever cases in Afro-Colombians. In the entire sample, this polymorphism, adjusted by the ancestral genetic component, was reproducible. In addition, there were significant associations between GGT and GAC allelic combinations of rs1800750, rs2069843, and rs2069705 in dengue hemorrhagic fever patients, with and without adjustment by ancestral genetic component. Additionally, the AGC allelic combination produced 58.03 pg/ml of interleukin-6 more than the GGC combination, regardless of European, Amerindian and African genetic components. Conclusions: The variants of GGT and GAC polymorphisms of rs1800750, rs2069843, and rs2069705 in the TNFA, IL6 and IFNG genes, respectively, were correlated with the susceptibility to dengue severity in a sample of Colombian population.


Subject(s)
Adolescent , Adult , Child , Female , Humans , Male , Middle Aged , Young Adult , Interleukin-6/genetics , Interferon-gamma/genetics , Tumor Necrosis Factor-alpha/genetics , Polymorphism, Single Nucleotide , Dengue/genetics , Polymorphism, Restriction Fragment Length , DNA, Viral/genetics , Ethnicity/genetics , Polymerase Chain Reaction , Risk , Cross-Sectional Studies , Prospective Studies , Colombia/epidemiology , Genetic Predisposition to Disease , Dengue/epidemiology , Dengue Virus/classification , Dengue Virus/genetics , Alleles , Genetic Association Studies , Gene Frequency , Genotype
4.
Biomédica (Bogotá) ; 35(1): 53-61, ene.-mar. 2015. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-745650

ABSTRACT

Introducción. Las poblaciones de Aedes aegypti pueden experimentar cambios en cuanto a su abundancia y diversidad genética y, con ello, su potencial evolutivo para responder al control vectorial. El conocimiento de los cambios en la variación genética a escala espacio-temporal, permite entender mejor la epidemiología del dengue y contribuye al diseño adecuado y oportuno de estrategias antivectoriales. Objetivo. Evaluar los cambios genéticos, la diversidad y el flujo génico en seis poblaciones microgeográficas de Ae. aegypti en Medellín en diferentes períodos epidemiológicos del dengue. Materiales y métodos. En 255 especímenes provenientes de seis barrios de Medellín, se evaluó la variación en la composición de los haplotipos mtDNA CO1 , así como la diversidad y la diferenciación genética en un período epidémico (2010) y en otro endémico (2012). Resultados. Se detectaron dos grupos de haplotipos muy diferenciados entre sí en ambos períodos, al igual que un haplotipo de alta frecuencia presente en todos los barrios. La mayor diversidad de haplotipos se registró en el 2012, pero la mayor diversidad de nucleótidos se presentó en el 2010. No se observó correlación significativa entre las distancias genéticas y geográficas. Conclusión. La composición genética de Ae. aegypti varía temporalmente sin un patrón predecible. La presencia de un haplotipo de gran frecuencia en ambos períodos podría ser indicio de una variación persistente adaptada al control vectorial. Sin embargo, la circulación simultánea de haplotipos CO1 muy diferenciados y compatibles con múltiples introducciones, sugiere que diversos acervos genéticos serían aptos para la transmisión. Estos resultados son compatibles con la dispersión del mosquito por efecto de actividades antrópicas, lo cual posibilitaría la diseminación rápida del virus durante epidemias en Medellín.


Introduction: Aedes aegypti populations may experience changes in abundance and genetic diversity in addition to changes in their evolutionary capability to respond to vector control. The knowledge on the changes in genetic variation on a spatio-temporal scale improves the epidemiological understanding of dengue and supports the appropriate and timely design of vector control strategies. Objective: To assess the genetic changes, diversity and gene flow in six microgeographical populations of Ae. aegypti in Medellín for different epidemiological periods of dengue. Materials and methods: A total of 255 specimens from six different neighborhoods in Medellín were used to assess variations in the CO1 mtDNA haplotype composition, diversity and genetic differentiation for an epidemic period (2010) and an endemic period (2012). Results: Two groups of highly differentiated haplotypes were present in both periods, and a high-frequency haplotype was assessed for all neighborhoods. The highest haplotype diversity was recorded in 2012, but the maximum nucleotide diversity was recorded in 2010. No significant correlation between genetic and geographic distances was observed. Conclusions: The genetic composition of Ae. aegypti varies over time without a predictable pattern. In addition, the presence of a high-frequency haplotype in both periods could indicate a persistent variation adapted to vector control. However, the simultaneous movement of highly differentiated CO1 haplotypes compatible with multiple introductions suggests that different gene pools would be suitable for transmission. These results are consistent with mosquito dispersion due to human activities, which would enable the rapid spread of the virus during epidemics in Medellin.


Subject(s)
Animals , Aedes/genetics , Genes, Insect , Genetic Variation , Colombia , Demography , Geography , Haplotypes
5.
Biomédica (Bogotá) ; 32(1): 71-76, ene.-mar. 2012. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-639813

ABSTRACT

Introduction. Polymorphisms in promoters of genes code for cytokines that affect transcription levels. Several have been associated with leprosy patients that have functional and clinical implications. Objective. Polymorphisms in the promoter of the IL10 gene of leprosy patients will be compared frequencies in normal population. Materials and methods. SNPs (single nucleotide polymorphism) -1082 A/G (rs1800896), -819C/T (rs1800871), and -592A/C (rs1800872) were identified in 100 leprosy patients and in a control group of 100 volunteers from a leprosy endemic region of Colombia. Results. The genotypes C/C and C/T in the SNP -819 were associated together with leprosy (OR=4.34, p<0.001).Similarly, the genotypes C/C and C/A in the -592 SNP showed an association (OR=4.3, p<0.001). The haplotypes -819C-519C and -1082A-819C-592C showed significant association (OR=4.34, p<0.001 and OR=6.25, p<0.001) respectively. These haplotypes in homozygosis conditions were also associated with leprosy: -819C-519C/-819C-519C (OR=4.34, p<0.001), -1082A -819C-592C/-1082A -819C-592C (OR=1.90, p=0.04). The SNP -1082 was not associated with leprosy in this population. Conclusions. The haplotypes associated with leprosy, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, have been reported as low producers of IL-10. Functionally, the low production of IL-10 may have immune response consequences and clinical implications. Additional haplotypes of IL-10 have been reported as markers for leprosy susceptibility or resistance in other ethnic populations. This suggests that differences in distribution of diverse IL-10 gene polymorphisms among ethnic groups may indicate important gene-disease associations.


Introducción. Se han reportado polimorfismos en los genes promotores que codifican para citocinas y que afectan los niveles de transcripción, con implicaciones clínicas y funcionales en pacientes con lepra. Objetivo. Detectar los polimorfismos en el gen promotor de la interleucina 10 (IL-10), de los polimorfismos de un solo nucleótido (Single Nucleotide Polymorphisms, SNP) -1082 A/G (rs1800896), -819C/T (rs1800871) y -592A/C (rs1800872), en 100 pacientes con lepra y un grupo control de 100 voluntarios, de una región endémica de Colombia. Resultados. Los haplotipos -819C-519C y -1082A-819C-592C mostraron asociación significativa con lepra: OR=4,34, p=1 x 10-3, y OR=6,25, p=5 x 10-4, respectivamente. Estos haplotipos en condiciones de homocigoto, están también asociados con lepra: -819C-519C/-819C-519C (OR=4,34 p=1 x 10-3), -1082A -819C-592C/-1082A -819C-592C (OR=1,90 y p=0,04). El SNP -1082 no se encontró asociado con lepra en esta población. Los genotipos C/C y C/T en el SNP -819, se encontraron asociados a lepra (OR=4,34, p=1 x 10-3); de igual manera, los genotipos C/C y C/A en el SNP -592 mostraron asociación (OR=4,34, p=1 x 10-3). Conclusiones. El haplotipo que encontramos asociado con lepra, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, se ha relacionado con baja producción de IL-10. Funcionalmente, esta baja producción de IL-10 puede tener consecuencias en la respuesta inmunitaria, además de implicaciones clínicas. Se han reportado diferentes haplotipos de IL-10 como marcadores de vulnerabilidad y resistencia de lepra en otras poblaciones, lo cual sugiere que las diferencias en la distribución de diversos polimorfismos del gen de IL-10 entre grupos étnicos, es un factor importante al determinar la asociación entre enfermedad y genes.


Subject(s)
Adolescent , Adult , Aged , Aged, 80 and over , Child , Female , Humans , Male , Middle Aged , Young Adult , /genetics , Leprosy/genetics , Polymorphism, Single Nucleotide , Promoter Regions, Genetic/genetics , Case-Control Studies , Colombia/epidemiology , Endemic Diseases , Ethnicity/genetics , White People/genetics , Gene Frequency , Genetic Predisposition to Disease , Genotype , Haplotypes , /biosynthesis , /physiology , Leprosy/epidemiology , Leprosy/microbiology , Mycobacterium leprae/isolation & purification
6.
Biomédica (Bogotá) ; 27(supl.1): 50-63, ene. 2007. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-475387

ABSTRACT

Introducción. Los estudios genéticos en Trypanosoma cruzi han buscado establecer asociaciones de variantes genéticas del parásito con manifestaciones clínicas de la enfermedad, origen biológico y geográfico de los aislamientos; sin embargo, los resultados de asociación con los marcadores comúnmente usados en estos estudios han generado mucha controversia, principalmente en la asociación de grupos con características clínicas y epidemiológicas de la enfermedad.Objetivo. Se planteó determinar la variabilidad de genes que codifican para las proteínas tripanotión reductasa y cruzipaína , involucradas en mecanismos de infección y supervivencia del parásito en el hospedador mamífero, y probar la asociación de variantes génicas con origen biológico y geográfico de cepas colombianas de T. cruzi. Materiales y métodos. Se tipificaron por reacción en cadena de la polimerasa- polimorfismo de longitud del fragmento de restricción seis SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) en tripanotión reductasa y ocho SNPs en cruzipaína en 36 cepas colombianas de T. cruzi de diferentes regiones y origen biológico.Resultados. Con las enzimas Acy I y Hae III se determinaron tres genotipos para tripanotión reductasa. Para cruzipaína se identificaron seis genotipos con las enzimas Rsa I, Ban I y Bsu 36I.Conclusiones. Para tripanotión reductasa no fue posible establecer una asociación con el origen biológico o geográfico; sin embargo los alelos producidos en las posiciones 102 y 210, permitieron discriminar los grupos tradicionales I y II. Con los genotipos obtenidos para cruzipaína se establecieron relaciones a estos grupos, origen biológico y geográfico. Los resultados sugieren la utilidad de estos genes como marcadores moleculares para determinar y diferenciar variedades genéticas en T. cruzi.


Introduction. Genetic studies of Trypanosoma cruzi have tried to establish relations between genetic variants and their biological characteristics, such as clinical manifestations, host or geographic origin. However, much controversy exists on the associations between the commonly used DNA markers with group, clinical characteristics and disease epidemiology. Objective. In this study determined the variability of the genes that code for the proteins trypanothione reductase and cruzipain, both involved in the infection and survival of the parasite in the mammalian host, was studied and the association between genetic polymorphism and biological and geographic sources in Colombian T. cruzi strains was examined. Materials and methods. The genotypes for each of six SNPs (single nucleotide polymorphisms) for trypanothione reductase and eight SNPs for cruzipain genes were identified by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism.in 36 T. cruzi Colombian stocks from several regions and biological origins. Results. Three genotypes were identified for trypanothione reductase with Acy I and Hae III enzymes and six genotypes for cruzipain with the Rsa I, Ban I and Bsu 36I enzymes. Conclusions. For trypanothione reductase ,an association was not established with biological or geographical origin; however, alleles at positions 102 and 210 allowed discrimination with groups I and II. For cruzipain, specific genotypes were associated with group, biological and geographic origin. The usefulness of molecular markers on these genes was demonstrated for the determination and differentiation of genetic varieties in T. cruzi.


Subject(s)
Trypanosoma cruzi , Genes, Protozoan , Polymorphism, Genetic , Polymorphism, Restriction Fragment Length
7.
Biomédica (Bogotá) ; 26(4): 538-545, dic. 2006. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-475401

ABSTRACT

Introducción. La utilización de la frecuencia de apellidos como marcadores de linajes paternos ha permitido caracterizar poblaciones. Los principios de isonimia se han empleado para determinar el grado de estructuración genética, las tasas de migraciones y las relaciones de ancestría y origen entre poblaciones. Este análisis se aplicó a dos poblaciones históricamente relacionadas y consideradas como aislados genéticos. Objetivo. Evaluar las relaciones genéticas y de origen entre Aranzazu y Marinilla y su zona de influencia por medio de análisis de frecuencia de apellidos. Materiales y métodos. A partir de la base de datos del Sistema de Identificación de Beneficiarios de los Programas Sociales, Sisbén, se calcularon los parámetros poblacionales de coeficiente de parentesco (ii), la homogeneidad poblacional con los estimadores B (porcentaje de la población que comparte los siete apellidos más frecuentes) y C (15 apellidos más frecuentes) y la distancia genética de Cavalli-Sforza en tres poblaciones del núcleo fundador de Marinilla y Rionegro como población externa. Resultados. Marinilla y Aranzazu, al igual que las poblaciones de Marinilla y su zona de influencia, mostraron los mayores valores de homogeneidad (valores B entre 0,25 y 0,5) comparados con Rionegro (B = 0,159) y también mayores valores de parentesco intrapoblacional (valores ii entre 0,0034 y 0,01). Las menores distancias se encontraron entre Marinilla y Aranzazu.Conclusiones. Aranzazu es una población con características similares a las de Marinilla y su zona de influencia y debido al efecto fundador, estas poblaciones pueden presentar características genéticas similares. Por lo tanto, las enfermedades genéticas, principalmente las de herencia compleja, podrían tener la misma etiología genética en ambas poblaciones, lo que garantizaría las condiciones óptimas para estudios de cartografía genética.


Introduction. Surname frequency (isonymy) is used as a marker of paternal lineage and is used to characterize human population structure. Principles of isonymy were used to determine the genetic structure, migration rates, ancestry relations and origins of populations. This analysis was applied to two historically related local populations which currently are considered to be genetically isolated. Objective. The genetic relationships and influence zones of the Aranzazu and Marinilla populations were assessed by means of surname frequency analysis. Materials and methods. Data originated from database with the title “System of Identification of Beneficiaries of the Social Programs” database or Sisben. Population parameters such as a priori kinship (fii), population homogeneity with B and C estimators, and Cavalli-Sforza’s genetic distance were calculated for (a) three towns of Marinilla and its influence zone and (b) Aranzazu. The Rionegro population served as an external, comparison population. Results. The Aranzazu and Marinilla populations showed the higher homogeneity (B value between 0.25 and 0.5) in contrast with Rionegro (B = 0.159), as well as greater a priori kinship values (fii between 0.003 and 0.010). The lowest distances were found between Marinilla and Aranzazu. Conclusions. Aranzazu is a population with characteristics similar to those of Marinilla and its influence zone. The close similarity of genetic characteristics for these populations is due probably to a founder effect. Furthermore, the genetic similarity predicts that genetic diseases will have the same etiology in both populations and provides optimum conditions for gene mapping studies.


Subject(s)
Genetics, Population , Names , Consanguinity , Founder Effect , Genetic Variation
8.
Biomédica (Bogotá) ; 23(1): 87-102, mar. 2003. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-356759

ABSTRACT

El grupo verrucarum comprende insectos vectores de Leishmania spp. y Bartonella bacilliformis, y se le considera uno de los grupos de flebotomíneos neotropicales más importantes en salud pública. Debido a la marcada semejanza morfológica entre las especies agrupadas, la identificación de algunos vectores se dificulta al utilizar caracteres taxonómicos convencionales, lo que ha hecho que sean objeto de estudio a través de quetotaxia, morfometría, sistema espiracular larval, estructura coriónica, morfología del atrio genital, citogenética, filogenética morfológica, isoenzimas, amplificación al azar de ADN polimórfico, hidrocarburos cuticulares, hibridación de ADN y secuencias nucleotídicas nucleares y mitocondriales. En la actualidad, el grupo se encuentra dividido en cuatro series de especies, verrucarum, serrana, townsendi y pia, con base en características de la terminalia masculina. Después de la revisión efectuada por Young y Duncan en 1994, se han descrito diez nuevos taxones, en su mayoría de origen andino, pertenecientes a las series verrucarum ( Lutzomyia maranonensis, Lutzomyia cajamarcensis, Lutzomyia antioquiensis, Lutzomyia falcaorum) , serrana ( Lutzomyia robusta, Lutzomyia guilvardae) y pia ( Lutzomyia suapiensis, Lutzomyia tihuiliensis, Lutzomyia tocaniensis, Lutzomyia limafalcaoae), lo que eleva a 40 el número de especies agrupadas. Esta diversidad parece ser el resultado de distintos eventos climáticos y biogeográficos entre los que se destacan el aislamiento de poblaciones ancestrales durante el cuaternario, el elevamiento de los Andes como barrera geográfica y el surgimiento del istmo de Panamá, lo que facilitó la dispersión de especies entre Sur y Centroamérica. El presente artículo revisa los más recientes avances en el conocimiento de la sistemática, biogeografía y evolución del grupo verrucarum, con énfasis en los 19 taxones presentes en Colombia.


Subject(s)
Leishmaniasis , Psychodidae , Phlebotomy
9.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 97(5): 645-647, July 2002. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-321207

ABSTRACT

Although once associated only with rural areas, the American leishmaniasis vectors now appear to be associated also with urban and suburban areas of the Neotropics. Following the appearance of the first autochthonous visceral and cutaneous leishmaniasis cases in the urban area of the city of Sincelejo, Colombia, a preliminary entomological survey of the sand fly species composition was performed using Shannon and CDC light traps. A total of 486 sand flies representing six Lutzomyia species were collected. L. evansi, L. panamensis and L. gomezi, known vectors of Leishmania spp. were the predominant sand fly species around dwellings. The finding of these species in relation to the appearance of the first cases of leishmaniasis in the city mentioned is discussed


Subject(s)
Humans , Animals , Male , Female , Insect Vectors , Leishmaniasis, Cutaneous , Leishmaniasis, Visceral , Psychodidae , Colombia , Urban Population
10.
Biomédica (Bogotá) ; 13(2): 94-101, abr. 1993. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-278105

ABSTRACT

Este taller se realizó con el propósito de transferir la tecnología de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para la detección de T. cruzi y T. rangeli a laboratorios en Colombia involucrados en el diagnóstico y estudios epidemiológicos de la enfermedad de Chagas. Para demostración de la técnica se utilizaron muestras clínicas y epidemiológicas de áreas endémicas colombianas. En los ensayos se emplearon muestras de tripanosomas provenientes de diferentes medios de cultivo para evaluar el posible efecto de los componentes de estos medios sobre la sensibilidad de PCR. Se hizo extracción de ADN utilizando los métodos de ebullición, lisis hipotónica y geneclean. El ADN se amplificó utilizando oligonucleótidos sintéticos, correspondientes a una secuencia conservada de 22 nucleótidos dentro de un gen mini-exón. Los dos organismos fueron distinguidos por las movilidades electroforéticas de sus respectivos productos de amplificación, confirmando su identidad con sondas intergénicas específicas de especie, marcadas con digoxigenina dUTP. La hibridación se visualizó con la reacción de color del NBT. De un total de 28 muestras analizadas, se lograron 17 identificaciones que coincidieron con la clasificación original. De cinco muestras desconocidas, tres fueron identificadas como T. rangeli y dos como infecciones mixtas. Se presentaron resultados ambiguos en dos muestras, ocasionados por contaminación en PCR. Solamente dos muestras no se pudieron identificar mediante PCR por problemas en la extracción del ADN de la muestra. Teniendo en cuenta estos resultados preliminares se abre la posibilidad de utilizar esta técnica como una herramienta útil o método adicional a las técnicas de rutina para detectar y diagnósticar la enfermedad de Chagas en Colombia


Subject(s)
Polymerase Chain Reaction/statistics & numerical data , Trypanosoma cruzi/isolation & purification , Trypanosoma/isolation & purification , Chagas Disease/diagnosis
11.
Gac. méd. boliv ; 15(1): 23-5, jun. 1991.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-127586

ABSTRACT

El objeto de este articulo es informar el caso de un nino de 2 anos de edad, quien presento en forma precoz a los 8 meses, una disminucion de la fuerza y una pseudo hipertrofia muscular, que condiciono al ano de edad una marcha de "pato" muy caracteristica y sintomatologica que fue incrementandose paulatinamente. Los estudios, diagnosticos comprendieron: electromiografia, en la que se encontro alteraciones electricas de patrones miopaticos, en sangre aumento de enzimas sericas (TGO, TGP, CPK). Todos estos cambios han sido reportados en la literatura extranjera, llamando la atencion de este caso la precocidad de su presentacion (8 meses). Esta patologia es una entidad rara, pero la mas frecuente dentro del grupo de enfermedades musculares progresivas, de etiologia familiar con herencia recesiva ligada al cromosoma X en un 70 // y en un 30 // de etiologia desconocida.


Subject(s)
Humans , Male , Child , Muscular Dystrophies/etiology , Biopsy/statistics & numerical data , Electromyography , Extremities/physiopathology , Muscles/physiopathology , X Chromosome/physiology
12.
Gac. méd. boliv ; 12(2): 47-50, jul. 1988. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-54457

ABSTRACT

En la ciudad de Cochabamba, en tres barrios socio-económicamente diferenciados, se realizó un estudio clínico epidemiológico sobre enfermedades neurológicas. Los resultados dan una primera aproximación sobre la magnitud y prevalencia de dichas dolencias y, sugieren un papel importante de los factores sociales y económicos en su patogénesis


Subject(s)
Child , Adult , Humans , Male , Female , Nervous System Diseases/epidemiology , Socioeconomic Factors , Bolivia , Epilepsy/epidemiology , Headache/epidemiology , Rural Population
13.
Cochabamba; s.n; 1987. 5 p. tab.
Non-conventional in Spanish | LILACS | ID: lil-202383

ABSTRACT

La distrofia muscular pseudohipertrófica tipo Duchenne, llamada tambien distrofia muscular progresiva infantil es una miopatía que aparece en la primera década de la vida de tipo progresivo y caracterizada por debilidad de diferentes grupos musculares. Se reporta un caso de distrofia muscular pseudohipertrófica presentado en el Hospital clínico Viedma de la ciudad de Cochabamba.


Subject(s)
Humans , Male , Child , Muscular Diseases/etiology , Muscular Dystrophies/rehabilitation , Child Welfare , Clinical Laboratory Techniques , Neurologic Examination/instrumentation
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